Harvest at a Japanese organic farm / Découverte d’une ferme bio japonaise

Inside the farm

(EN) Today, through one of the fun activities proposed by Coto (the Japanese language school I go every week) I had the opportunity to visit an organic farm in Chiba. This was really precious because such occasions to visit a place of true Japanese lifestyle are rare.

This organic farm is managed by the owner on his own. He cultivates various sorts of vegetables, like potatoes, sweet potatoes (サツマイモ), tomatoes, … and herbs like okra. He does his job without any pesticide or chemical products. We even saw how he produces his compost, recycling a large set of wastes such that natural chemical reactions occur.

The organic market does not seem wide in Japan for the moment. One of the organizers of today’s tour, from the Vege-link company, told us that it represents currently an average 1%. But it is refreshing and encouraging to see people with such motivation in mind. The farmer explained us that he hasn’t need any medical care for 30 years. Because he pays attention to what he eats. He cares about giving rise to healthy food. As a manga/anime fan, this immediately echoes with some dialogs in Earth Maiden Arjuna or Silver Spoon.

We did not only get the chance to visit the farm, but also to harvest sweet potatoes and peanuts following the farmer’s advices. For me (as a very « city person »), it was my first time harvesting such vegetables. This was very moving, in the sense that such an action really connects us to the soil. After these (tiny) efforts (which are nothing compared to the huge amount of work performed everyday by the farmer), we enjoyed a barbecue with fresh products. This was really tasty.

The way the farmer and his family received us was really warming. The Japanese sense of hospitality continues to impress me every day.

This was one of these Sundays I’ll remember for long.

(FR) Dans le cadre des activités proposées par Coto, l’école de japonais à laquelle je suis inscrit, j’ai pu me rendre dans une ferme bio dans la région de Chiba. Il s’agissait là d’une véritable chance car les occasions de visiter de tels lieux, qui plus est au Japon, sont peu fréquentes !

La ferme en question est géré directement par son propriétaire. Il cultive une large gamme de légumes, tels que des pommes de terres, des patates douces (mais dans leur variété japonaise que les Français connaissent en fait peu : les satsumaimo – サツマイモ), des tomates et des herbes telles que l’okra. Il fait son travail sans énorme machine, sans pesticide et sans produit chimique. Tout à la main. Nous avons même vu comment il produit son compost, recyclant une large gamme de déchets d’une telle manière que des réactions chimiques naturelles s’occupent du reste. Il y a même des personnes qui sont allées constater, dans la montage de compost, que les réactions en question produisent, par elle-même, une chaleur comparable à celle d’un sauna !

Au Japon, la production bio ne paraît pas très importante en volume pour le moment. L’une des organisatrices de cette journée, de l’entreprise Vege-link, nous disait ainsi que le bio représente environ 1%. Mais cela fait plaisir – et c’est même sacrément encourageant – de voir des personnes avec autant de motivation ! Le fermier nous a ainsi expliqué qu’il n’avait plus eu à subir de traitement médical depuis 30 ans ! Parce qu’il porte attention à ce qu’il mange. Parce qu’il prend soin de cultiver une nourriture saine… en tant que fan de manga et d’anime, un tel discours faisait d’ailleurs écho au propos de séries tels que Earth Girl Arjuna ou Silver Spoon.

Nous n’avons pas eu seulement la chance de visiter la ferme, mais aussi de récolter des patates douces et des cacahuètes en suivant les conseils du fermier. En tant que citadin pur souche, c’était la première fois que je m’adonnais à une telle activité. C’était vraiment enthousiasmant, au sens où cette action nous rappelle l’importance des produits terriens dans notre quotidien. Après ces (minuscules) efforts (qui ne sont vraiment rien comparé au travail abattu chaque jour par le fermier), nous avons pu profité d’un barbecue avec un aperçu des aliments frais produits par la ferme. C’était vraiment délicieux. Et nous avons été tellement bien accueilli par tout le monde. Le sens de l’hospitalité japonais continue chaque jour de m’impressionner.

En tout cas, il s’agissait d’une expérience vraiment unique, de celle dont on se souvient pendant longtemps !

Invited Talk at Systems Resilience Workshop in Karuizawa: Resilience in the mammalian circadian clock

The National Institute of Informatics (NII) possess this gorgeous seminar house in Karuizawa. It was built on land donated by Dr. Hiroshi Inose, the first director general of NII. According to the website of NII, Dr Inose's idea was to create an ideal place for interdisciplinary and international discussions.

I have been invited to give a talk at a workshop of the Transdisciplinary Research Integration Center Systems Resilience project at the International Seminar House for Advanced Studies in Karuizawa (in the Nagano prefecture).

Since the 2011 Tōhoku earthquake and tsunami, resilience is a key research topic in Japan. What lies behind this notion? Without going into the details that the community addresses in the papers on this topic, this is roughly the capacity of a system to absorb sudden changes in the (social, environmental, medical, …) environment while maintaining its key features. This concept is of interest in a wide range of sectors: in the societal domain (ensure the proper functioning of a city or a country when the devastating earthquake), in psychology (to recover from a traumatic event), etc.

I took the opportunity of this workshop to present some thoughts of a joint project with researchers from University of Nice about the circadian rhythm, that appears to be a very resilient biological system that discrete approaches can help to analyze.

This talk was part of my activity as JSPS invited researcher at Inoue Lab, National Institute of Informatics (Tokyo).


  • Title: Resilience in the mammalian circadian clock
  • Place: Karuizawa, International Seminar House for Advanced Studies
  • Date: 2014/09/01
  • Duration: 20 minutes
  • Attendance: 20+ persons (researchers, PhD students)

Invited Talk at 5th CSPSAT2 meeting in Kobe University: Challenges of model-checking of hybrid systems

View on Kobe from the Rokkodai campus of Kobe University

I have been invited to give a talk at the 5th CSPSAT2 meeting in Kobe University on the challenges of model-checking and its connection with Constraint Satisfaction Problem and Boolean satisfiability. This was really enriching to give such a presentation to an audience expert with CSP and SAT approaches. This raised many interesting questions, especially with regard to the applicability of these methods to large-scale industrial cases studies.

This talk was part of my activity as JSPS invited researcher at Inoue Lab, National Institute of Informatics (Tokyo).


  • Place: Kobe, Kobe University, Rokko campus
  • Date: 2014/08/21
  • Duration: 1 hour
  • Attendance: 20+ persons (researchers, PhD students)

Gundam Reconguista in G (ガンダム Gのレコンギスタ) screenings in Japan / Les projections en avant-première de Gundam Reconguista in G au cinéma au Japon

Gundam Reconguista in G

(EN) In the continuation of the 35th anniversary of the franchise, two new Gundam series will be broadcasted at Japanese TV starting this October.

One, Gundam Build Fighters Try (ガンダムビルドファイターズトライ), is actually the second season of Gundam Build Fighters. It will be a sequel to the story aired between October 2013 and March 2014. This new interpretation of the Gundam world focuses on Gunpla, these plastic models that have so much success in Asia.

The second, Gundam Reconguista in G (ガンダム Gのレコンギスタ) will be a brand new original work, marking the return of original series creator, Yoshiyuki Tomino (72 years old!). To support the buzz around this new series, Sunrise organizes – from August 23rd to September 5th – screenings in Japanese theaters, giving the opportunity to experience the first three episodes of this highly anticipated anime. I could not miss that!

Gundam Reconguista in G may well be followed by spectators who have never seen any of the previous series. The plot is located in a new timeline, called Regild Century (RC). This is supposed to take place well after the Universal Century timeline. A reference to it is made in episode 2, and we can imagine that other links may be, perhaps, revealed later.
Without much spoil the plot, the series is set in the year R.C.1014. The first episodes take place in space and in the north of Capital Territory (to refer to the world map, this area corresponds to South America; the map revealed so far shows four areas in the world: Ameria for North America, Capital Territory for South America, Gondwan for Europe and Izanel for Africa – no trace of Asia at the moment).

The main character is called Bellri Zenam (ベルリ · ゼナム). He is a young rookie in Capital Guard, the military organization in charge of protecting a space elevator named Capital Tower. When, in the first episode, this space elevator is attacked, Bellri will face a robot of a new genre, the G-Self, and his driver with a strong character, Aida Surugan (アイーダ · スルガン). It turns out pretty quickly that Bellri can control the G-self, which seems to make him a special person. As well as another girl, Raraiya Monday, introduced in the first few minutes. Episode 1 introduces the universe and the characters and mecha. Episode 2 focuses on the G-self and Aida. It stages the first heated confrontation between Capital Guard and an army faction wishing to deliver Aida. Finally, episode 3 involves a new character, Nick Klim, who allies himself with the pirates operating in this area, and who also desires to release Aida.

Love feelings and mechas, this seems to be the recipe for this new Gundam. The atmosphere is completely from different series in recent years, like Gundam 00, Gundam Age or Gundam Unicorn. To get an idea of the atmosphere of Gundam Reconguista in G, we must remember Overman King Gainer, the series that Tomino signed in 2002. He already proposed some mechas designs and story radically different, with a dose of humor, while allowing for surprising twists. Gundam Reconguista in G is gone to be in the same vein. The clashes are intense, but with a different voltage, for example, that of Gundam 00 or Gundam Unicorn. Even in the heart of the action, a slightly lighter scene may occur. Reversely, a tragic death brings consequences, but it is not hackneyed pathologically for dozens of minutes.

Yoshiyuki Tomino seems to know where he wants to go. Its bias – that is apparent from the very design of the G-self – will surely raise mitigated feedback. But Gundam Reconguista in G will probably be more satisfactory than the so-so recipe of Gundam Age. Because the series is conducted by an author who, in the twilight of his career, seems to know exactly what he wants to bring to a genre that he already revolutionized 35 years ago.

PS: the world of mecha is made of great metaphysical questions such as “why Duke Fleed’s cockpit has to turn twice in Grendizer?” or “How do mecha pilots to relieve themselves?”… in the third episode of Gundam Reconguista in G, an answer to the second question is given. I am however not sure that the above-mentioned existential questions should all be answered ;-)

(FR) Dans la foulée des célébrations autour du 35e anniversaire de la franchise, le mois d’octobre verra débarquer à la télévision japonaise deux nouvelles séries Gundam.

L’une, Gundam Build Fighters Try (ガンダムビルドファイターズトライ), est en fait la deuxième saison de Gundam Build Fighters, prenant la suite de l’histoire diffusée entre octobre 2013 et mars 2014. Cette nouvelle déclinaison de l’univers Gundam se focalise sur les Gunpla, ces maquettes en plastique qui ont tant de succès en Asie.

L’autre, Gundam Reconguista in G (ガンダム Gのレコンギスタ), sera une oeuvre totalement originale, marquant le retour du créateur original de la série, Yoshiyuki Tomino (72 ans !), aux commandes. Pour faire monter le buzz, Sunrise propose – du 23 août au 5 septembre – des projections dans les cinémas japonais, donnant l’occasion de découvrir les trois premiers épisodes de cet anime très attendu. Je ne pouvais pas manquer cela !

Gundam Reconguista in G peut très bien être suivie par des spectateurs qui n’ont vu aucune des précédentes séries. L’intrigue se situe dans une nouvelle ligne temporelle, baptisée Regild Century (R.C.). Celle-ci est censée se placer bien après la chronologie de l’Universal Century, auquel il est d’ailleurs fait un clin d’oeil dans l’épisode 2. On peut imaginer que d’autres liens seront, peut-être, révélés plus tard.
Sans trop déflorer l’intrigue, la série se situe durant l’année R.C. 1014. Les premiers épisodes se situent dans l’espace, mais surtout au nord de Capital Territory (ramenée à la carte du monde, cette zone correspond à l’Amérique du Sud, la cartographie dévoilée jusque là montrant quatre zones dans le globe : Ameria pour l’Amérique du Nord, Capital Territory pour l’Amérique du Sud, Gondwan pour l’Europe et Izanel pour l’Afrique – pas de trace de l’Asie pour le moment).

Le personnage principal s’appelle Bellri Zenam (ベルリ・ゼナム). C’est une jeune recrue de Capital Guard, une organisation militaire chargée de protéger l’ascenseur spatial nommé Capital Tower. Lorsque, dans le premier épisode, cet ascenseur est attaqué, Bellri va faire face à un robot d’un nouveau genre, le G-Self, et à sa pilote au fort caractère, Aida Surugan (アイーダ・スルガン). Il s’avère assez rapidement que Bellri peut piloter le G-self, ce qui semble faire de lui un être spécial. Tout comme une autre jeune fille, Raraiya Monday, introduite dans les toutes premières minutes. L’épisode 1 présente l’univers et les personnages, ainsi que de premiers mecha. L’épisode 2 se focalise sur le G-self et Aida. Il met en scène le premier affrontement vif entre Capital Guard et une faction armée souhaitant délivrer Aida. Enfin, l’épisode 3 fait intervenir un nouveau personnage, Klim Nick, qui s’allie aux pirates opérant dans cette zone, et qui lui aussi désire libérer Aida.

Sentiments amoureux et mechas, telle semble être la recette de ce nouveau Gundam. L’ambiance est radicalement différente des séries de ces dernières années, que ce soit Gundam 00, Gundam Age ou Gundam Unicorn. Pour se faire une idée de l’atmosphère de Gundam Reconguista in G, il faut se rappeler de Overman King Gainer, la série que Tomino a signée en 2002. Déjà, il sortait des sentiers battus en proposant des mechas radicalement différents, avec une dose d’humour, tout en se permettant des retournements de situation surprenants. Gundam Reconguista in G est parti pour être dans la même veine. Les affrontements sont intenses, mais avec une tension différente, par exemple, de celle de Gundam 00 ou Gundam Unicorn. Même en plein coeur de l’action, une scène un peu plus légère peut survenir. Inversement, une mort tragique porte des conséquences, mais elle n’est pas ressassée de manière pathologique pendant des dizaines de minutes.

Yoshiyuki Tomino semble savoir où il veut aller. Ses parti-pris – qui se sentent jusque dans le design du G-self – diviseront sûrement. Mais Gundam Reconguista in G remportera sans doute plus d’adhésion que la recette tiède de Gundam Age. Car il y a là un auteur qui, au crépuscule de sa vie professionnelle, semble savoir exactement ce qu’il souhaite apporter à un genre qu’il a déjà révolutionné 35 ans auparavant.

PS : le monde du mecha est fait de grandes interrogations métaphysiques telles que « pourquoi le cockpit d’Actarus tourne-t-il deux fois dans Goldorak ? » ou « Comment font les pilotes de mecha pour satisfaire leurs besoins naturels ? »… Gundam Reconguista in G propose une réponse à la deuxième dans l’épisode 3. Pas sûr toutefois que les questions existentielles sus-citées méritent toutes qu’on y réponde ;-)

Research activity in July 2014

Gorgeous view on the Japanese Imperial Palace and Garden, from one of the meeting rooms at the National Institute of Informatics, Tôkyô

July has been my second month as JSPS fellow in National Institute of Informatics, Tôkyô. I have continued to work on different collaborations here with Japanese researchers, both on bioinformatics (especially in the learning of gene regulatory networks) and systems resilience.

International (peer-reviewed) conferences

I got two new accepted papers:

  • T. Ribeiro, M. Magnin, and K. Inoue. Learning delayed influence of dynamical systems from interpretation transition. To appear in the 24th International Conference on Inductive Logic Programming. 6 pages (short paper). Nancy, France, September 2014.In a nutshell: This paper addresses the learning of (synchronous) logical programs with delayed influences from state transition diagrams. Delayed influences are captured with an inductive logic programming methodology.
    Note: This paper results from my collaboration with Inoue Lab. at NII.
  • S. Carolan, M. Magnin and A-L. Kabalu. Sparking a Digital. Revolution: Digital Educational Tools in Fragile and Emerging Learning Contexts. In the 1st International Conference dedicated to Digital Society and Cultures (DI’2014). Nantes, France, September 2014.In a nutshell: This paper discusses the crucial issue of teaching and learning for people in hard environments (e.g. warzones, countries with poor or broken Internet connections, etc.) and gives insights about the added-value of recent e-Learning methods.
    Note: This paper results from joint work with Simon Carolan (2nd year PhD student who I co-supervise) and Anne-Laure Kabalu (Master student who Simon and I have co-supervised this Spring).

Students’ talks

Meanwhile, the PhD and Master students I co-supervise have presented some recent works at some international conferences and research schools: